En el máster en Microbiología Aplicada se imparten los conocimientos avanzados, metodológicos y aplicados del campo de la microbiología. Tiene como misión principal formar profesionales capacitándolos para incorporarse  en el mundo industrial, sanitario y de la investigación. El plan de estudios permite al estudiante adquirir una visión multidisciplinar e integradora del conocimiento de la microbiología ambiental, molecular, médica e industrial a través de módulos obligatorios así como una amplia formación práctica a través de prácticas profesionales obligatorias de investigación en Laboratorios de centros de investigación públicos o privados, que harán posible el contacto directo con la realidad profesional durante el curso.
 
Los diferentes módulos cuentan con la participación de profesionales con un profundo conocimiento de la microbiología en los ámbitos de la investigación y de la empresa, y reflejan la excelencia del personal docente que colabora, avalada por la acreditación de la Agència per a la Qualitat del Sistema Universitari de Catalunya. El máster cubre también los requisitos académicos de formación para los estudiantes de máster que quieran realizar estudios de doctorado.