El Máster en Biología de la Conservación tiene como objetivo la formación de expertos en el diagnóstico de los problemas de la conservación de la biodiversidad y en cómo abordar sus soluciones. La biodiversidad es considerada como la variedad de la vida en todas sus formas y niveles de organización, incluyendo los procesos ecológicos y evolutivos que la mantienen, por lo que su conservación requiere la formación de profesionales capaces de aplicar aproximaciones transversales. La Biología de la Conservación ha ido creciendo como una respuesta transdisciplinar a la crisis planetaria de biodiversidad, con una clara vocación integradora de disciplinas muy diversas del campo de la biología, a las que se han unido recientes desarrollos de la sociología y de la economía.

El máster en Biología de la Conservación recoge esa necesidad de integración gracias a la colaboración de los profesores de la UCM con investigación vinculada al campo de la conservación, pertenecientes a las áreas de conocimiento de Botánica, Ecología, Genética y Zoología, ahora integradas en el departamento de Biodiversidad, Ecología y Evolución y en el de Genética, Fisiología y Microbiología de la Facultad de Ciencias Biológicas; investigadores del departamento de Mejora Genética Animal del INIA-CSIC (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Consejo Superior de Investigaciones Científicas) completan el elenco de profesores. Investigadores y profesionales invitados, participan habitualmente para enriquecer los contenidos curriculares.

En el curso académico 2015-2016 se introdujo el programa actualmente vigente en el Máster, con asignaturas agrupadas en tres materias, la primera con seis asignaturas obligatorias de Fundamentos de Biología de la Conservación, para garantizar la formación transdisciplinar del estudiante, el segundo de Gestión en Biología de la Conservación, con asignaturas de caracter optativo para permitir una mayor especialización, y el tercero con el Trabajo de Fin de Máster.